Equipo cercano
Contacto directo con las personas que diseñan y desarrollan GARA, sin capas comerciales entre el laboratorio y la solución.
Tecnología biomédica hecha en Santiago
De la secuencia al análisis 3D, en un único flujo.
Predice proteínas y complejos con AlphaFold2, ESMFold, Boltz y OpenFold3. GARA gestiona el cómputo en FinisTerrae III y reúne el visor, pLDDT, PAE y la exportación de resultados en tu navegador.
- Sin configurar entornos
- Sin gestionar colas
- Cómputo en CESGA
Interfaz real de GARA · ejecución en CESGA · pLDDT y PAE en contexto
Desde Galicia
Una solución de aquí, construida cerca de quien investiga.
GARA se desarrolla en Santiago de Compostela, dentro de un ecosistema que conecta universidad, centros de investigación y supercomputación. Esa proximidad nos permite escuchar a cada grupo y convertir necesidades reales en herramientas útiles.
Infraestructura gallega
Los trabajos se orquestan sobre FinisTerrae III, la infraestructura de supercomputación del CESGA.
Soluciones a medida
Adaptamos entradas, análisis y flujos a las necesidades científicas de cada grupo, validándolos junto a sus investigadores.
Un proyecto del ecosistema gallego
Un flujo completo, sin cambiar de herramienta.
Introduce lo que quieres estudiar. GARA localiza estructuras existentes, prepara la predicción, gestiona el trabajo en CESGA y reúne el resultado en el mismo espacio.
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Paso 1
Introduce o buscaEmpieza con tu sistema
Busca una proteína o define tu entrada en FASTA y en los formatos estructurados disponibles para complejos.
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Paso 2
PrediceConfigura sin operar el clúster
Elige el motor adecuado y envía. GARA prepara el trabajo y gestiona su ejecución en FinisTerrae III.
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Paso 3
Estado del trabajo
BuscandoBuscando en caché local y AlphaFold DB…
GARA · CESGA · FTIII
AnalizaInterpreta y exporta
Sigue el estado en vivo y abre estructura, confianza y propiedades en cuanto finaliza el trabajo.
De la entrada al resultado, con el contexto en el mismo lugar.
GARA conecta motores, visualización y análisis para evitar un flujo fragmentado entre scripts, servidores y aplicaciones independientes.
El motor adecuado para cada problema
Proteínas aisladas y complejos con las entidades admitidas por cada integración.
Visor 3D interactivo con Mol*
Representaciones estructurales, coloración, selección, medidas, contactos y propiedades sin salir del navegador.
- Cintas, superficies y detalle atómico
- Distancias y contactos
- Coloración por confianza y propiedades
Confianza y resultados trazables
Lee la predicción con sus métricas y conserva las salidas que necesitas para continuar el trabajo.
- pLDDT global y por residuo
- Matriz de error PAE
- Exportación PDB, PNG y PDF
La plataforma se adapta a tu investigación. No al revés.
La ventaja de desarrollar GARA cerca de los grupos es poder ir más allá de un catálogo cerrado. Entendemos el caso científico, configuramos el flujo y validamos la solución con quienes van a utilizarla.
“No queremos que un grupo cambie su forma de investigar para encajar en la herramienta. Queremos que GARA encaje en su trabajo.”
El mismo equipo que desarrolla la plataforma participa en la definición y validación de cada adaptación.
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01
Entender
Partimos de las moléculas, entradas, análisis y decisiones que forman el flujo real del grupo.
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02
Configurar
Ajustamos motores, formatos, visualizaciones e integraciones a las necesidades acordadas.
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03
Validar juntos
Probamos el flujo con casos reales, recogemos feedback y mejoramos la solución de forma iterativa.
El trabajo
Flujo manual
Portal genérico
Con GARA
Puesta en marcha
Entornos y scripts
Configuración estándar
Acceso desde navegador
Cómputo
Operación de Slurm
Infraestructura externa
Orquestación en CESGA
Análisis
Herramientas separadas
Flujo predefinido
Visor y métricas integrados
Adaptación
Desarrollo propio
Catálogo cerrado
Trabajo directo con el grupo
Confianza y trazabilidad
Resultados que puedes interpretar y auditar.
Una estructura no es una respuesta aislada. GARA mantiene a la vista las métricas, propiedades y salidas necesarias para evaluar cada resultado.
pLDDT global y por residuo con su escala de confianza.
PAE para interpretar la fiabilidad relativa entre regiones y dominios.
Análisis integrados para mantener estructura y contexto en el mismo espacio.
Salidas reutilizables para continuar el trabajo fuera de GARA.
53,19
pLDDT globalConfianza moderada
Acceso
Construyamos el flujo que necesita tu grupo.
Estamos validando GARA con grupos de investigación biomédica. Cuéntanos qué estudias, qué herramientas utilizas y dónde aparece la fricción: hablaremos contigo para valorar cómo puede ayudarte la plataforma.
Santiago de Compostela · Galicia
Preguntas frecuentes
¿Quién puede solicitar acceso?
Grupos de investigación que trabajen con estructura de proteínas, complejos moleculares o análisis relacionados. Revisamos cada solicitud para conocer el caso y el encaje.
¿Qué tipos de entrada admite GARA?
La plataforma trabaja con proteínas y complejos mediante FASTA y los formatos estructurados disponibles para cada motor. El equipo confirma el flujo adecuado para cada caso.
¿Dónde se ejecutan los trabajos?
GARA orquesta los trabajos de predicción sobre FinisTerrae III, en el Centro de Supercomputación de Galicia.
¿Necesito experiencia en HPC?
No. La plataforma está diseñada para evitar la configuración de entornos, el acceso por terminal y la gestión manual de las colas.
¿Se puede adaptar a nuestro grupo?
Sí. La proximidad es parte del proyecto: estudiamos necesidades concretas y acordamos las adaptaciones que aporten valor al flujo científico.