El portal web unificado para predecir y analizar la estructura de proteínas. Sin terminales, sin colas, sin salir de la web.
Cátedra CAMELIA · CiMUS · CiTIUS · CESGA
01 — Por qué importa
Conocer cómo se pliega una proteína lo cambia todo.
La predicción de la estructura 3D es el pilar de la investigación biomédica: entender enfermedades y diseñar fármacos.
El «mapa» que los biólogos necesitan para hacer ciencia de vanguardia.
02 — La tecnología existe
El problema, técnicamente, está resuelto.
AlphaFold y OpenFold ya predicen estructuras con precisión equiparable a la experimental.
El reto algorítmico —el que costó décadas— ya no es el obstáculo.
# para usar AlphaFold hoy…
$ conda activate alphafold-env
$ module load cuda/12.2 cesga/system
$ sbatch --gres=gpu:a100 run.slurm
PENDING · esperando GPU…
03 — Pero no llega al laboratorio
No están hechas para biólogos.
A pesar de existir, no se usan en el día a día. Para lanzarlas hace falta:
- Manejar terminales Linux.
- Dependencias (Conda, CUDA) y entornos virtuales.
- Colas (SLURM) en supercomputadores.
04 — Qué nos hace diferentes
Factores diferenciadores.
Para biólogos
Usuario no experto
Interfaz simple e intuitiva.
Privacidad
Tu secuencia no sale
Control total de tus datos.
Soberanía
Control local
Infraestructura propia, sin intermediarios.
05 — Ecosistema
Posible gracias a…
06 — El equipo
Somos GARA.
JO
Javier Outeiriño Cortés
HG
Hugo Gómez Randulfe
PP
Pablo Pardo Cotos
NS
Noel Suárez Barro
ColaboradorBR